经过检验种子的发芽率还是比较符合播种种子的要求的，尤其是对出苗后不长或者是不出苗的都有着显著的成效。通过相关部门审核过的品种在使用的时候如果发现一些严重的种子退化问题或者是劣质种子的质量问题时，我们都是可以通过相关部门来解决的。我们通常情况下所说的种子质量不合格，一般都是指种子的质量不符合一定的法律法规，或者是国家相关种子单位的规定，其中包括种子的生产、加工包装以及检验都是不符合标准的，质量不合格的种子我们称之为不合格种子。
种子使用者享有的向出售种子的经营者的“赔偿权"， 与出售种子的经营者享有的向种子生产者或者其他经营者的“追偿权"，权利主体和权利性质均不同。 种子生产者或者其他经营者与出售种子的经营者向种子使用者承担的是连带赔偿责任。种子瑕疵的责任主体 、 性质和形式 因种子瑕疵造成种子使用者损失的，由出售种子的经营者向种子使用者承担赔偿责任。种子缺陷的责任主体 、 性质和形式 因种子缺陷对人类、动植物、微生物、生态环境、人身或他人财产造成损害的，由转基因品种的培育人、审定人或药剂处理种子的生产者、种子经营者向受害者承担赔偿责任。
种子质量虽符合法定或约定的标准即合格， 但种子标准样品库仍可能存在某种缺陷、瑕疵或缺点。因为不但合同约定的质量标准会受到当事人认识水平的限制， 即便国家制订的有关种子质量标准也会受到现有的科技发展水平等多种因素的制约， 在实践中难免出现虽种子质量符合标准但却存在瑕疵、缺陷或缺点等质量问题。在我国，固然法律对很多种子和性状指标规定了质量标准，但也有很多种子和性状指标没有或无法制定标准。
