研究肿瘤的新方法
2011-03-22 12:17:15上海科源生物科技有限公司阅读量:1337 我要评论
导读:
随着发展肿瘤成了人们的心中大患,冷泉港实验室遗传学专家Michael Wigler教授,他曾揭示过自闭症的遗传机理,人类基因组的大范围变异,以及乳腺癌分子机理等重要的疾病机理。并且研究中心的人员提出了了一种分析研究癌变肿瘤的新方法,并且研究人员还发现肿瘤可能并不是逐步演变的,而是间断性发生的,这对于肿瘤发生,转移研究具有重要的意义,也有助于临床肿瘤诊断。这一研究成果公布在Nature在线版上。
Wigler教授认为,“这项研究证明我们能通过对癌变肿瘤中的一个单细胞进行测序,获得的高通量拷贝数”,“检查同一癌症的多个细胞,我们就能了解这种癌症是如何发生与扩散的”。
这种由冷泉港实验室开发的分析方法就是单细胞测序技术(single cell sequencing,SNS),这种方法能准确定量一个单细胞核中基因拷贝数目。癌细胞中,基因组部分被删除,或者扩增,从而引起关键基因的缺失,或者表达过量,干扰正常细胞生长,因此利用这种方法就能分析基因拷贝数目,从而诊断癌症。“我们希望了解转移扩散是如何发生的”,Hicks说,“而且现在我们有能力进行详细分析,从一个癌症患者的正常抽血样品中一般能观察到5-20个肿瘤细胞,这是转移的一个标志,我们可以看到这每一个细胞,并且分析是否在这个原发肿瘤细胞群体中出现了一个新克隆,通过逐层,逐个细胞的分析,我们对肿瘤转移扩散,以及发生有了深入的了解,”
许多肿瘤细胞(大约30%)都混合包含有DNA缺失和增加的清楚,从而就总体DNA数目而言,看上去和正常细胞一样,研究人员将这种细胞称为假二倍体(pseudodiploid),并采用新技术鉴别了这种细胞——利用传统的方法是无法分辨这些细胞与正常细胞的。有人认为这种细胞是未来克隆事件的潜在来源,还有人认为这种细胞对于肿瘤转移意义重大。研究人员发现转移至肝脏的肿瘤在基因型上非常接近,这些亚群并没有混合在一起。文章采用了一种称为染色体断点分析(chromosomal breakpoint analysis)的方法,来分析不同肿瘤细胞亚群之间的联系,Hicks说“这些断点记录了细胞的历史”,“它们是突变事件的产物,只要发生了DNA重排,就会出现这些记录”。
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